Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf2B2RT44 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Lonrf2B2RT44 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf2B2RT44 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf2B2RT44 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms