Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssxa1B1AUS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssxa1B1AUS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssxa1B1AUS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssxa1B1AUS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxa1B1AUS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxa1B1AUS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxa1B1AUS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxa1B1AUS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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