Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm16430A6X8J1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm16430A6X8J1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm16430A6X8J1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm16430A6X8J1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm16430A6X8J1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms