Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htra4A2RT60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htra4A2RT60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Htra4A2RT60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htra4A2RT60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms