Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N8

L3mbtl1, Lethal(3)malignant brain tumor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3mbtl1A2A5N8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3mbtl1A2A5N8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3mbtl1A2A5N8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3mbtl1A2A5N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3mbtl1A2A5N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3mbtl1A2A5N8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3mbtl1A2A5N8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L3mbtl1A2A5N8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L3mbtl1A2A5N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3mbtl1A2A5N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms