Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDO1Q16878 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDO1Q16878 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDO1Q16878 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDO1Q16878 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDO1Q16878 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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