Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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