Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms