Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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VPS72Q15906 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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