Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USF2Q15853 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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