Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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