Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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