Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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