Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms