Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DSC3Q14574 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms