Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms