Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CAPSQ13938 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CAPSQ13938 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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