Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SP140Q13342 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms