Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms