Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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