Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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