Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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