Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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