Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms