Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms