Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMOD1P29536 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMOD1P29536 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms