Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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