Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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