Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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EHD3Q9NZN3 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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EHD3Q9NZN3 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
EHD3Q9NZN3 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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