Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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