Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAPPC9Q96Q05 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms