Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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