Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms