Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDO1Q16878 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms