Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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RTN1Q16799 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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