Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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ZNF239Q16600 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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