Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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