Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms