Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms