Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms