Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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