Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms