Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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