Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms