Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
APOFQ13790 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
APOFQ13790 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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