Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms