Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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