Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BNIP3Q12983 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms