Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms