Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN8O00124 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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